一颗陨石坠落到地球的海洋中，造成海水蒸发，大片海洋消失。地球的气候因此出现异常，人类的生存环境不断恶化，地球上的树木枯萎，土地都变成了沙漠。更可怕的是，从那颗陨石中冒出了大量的外星生物异虫，它们有着强大的力量，并开始侵略人类的世界，让人类处在恐慌之中。 为了对抗外敌的入侵，人类组成杰特这个特殊武力组织，并且花费人力物力开发出了假面骑士系统。然而，一些杰特的成员因不满杰特的做法，而选择脱离组织，成立了一个新的组织——新杰特。 杰特和新杰特冲突不断，在一次杰特与新杰特的对抗中，一个神秘的男子天道总司出现了，他拥有变身成为假面骑士甲斗王的强大能力，但却不属于任何一个组织，这让交战双方都感到非常惊讶。 其实在这场纷争背后，有一个可怕的阴谋正在悄悄地进行……

一颗陨石坠落到地球的海洋中，造成海水蒸发，大片海洋消失。地球的气候因此出现异常，人类的生存环境不断恶化，地球上的树木枯萎，土地都变成了沙漠。更可怕的是，从那颗陨石中冒出了大量的外星生物异虫，它们有着强大的力量，并开始侵略人类的世界，让人类处在恐慌之中。 为了对抗外敌的入侵，人类组成杰特这个特殊武力组织，并且花费人力物力开发出了假面骑士系统。然而，一些杰特的成员因不满杰特的做法，而选择脱离组织，成立了一个新的组织——新杰特。 杰特和新杰特冲突不断，在一次杰特与新杰特的对抗中，一个神秘的男子天道总司出现了，他拥有变身成为假面骑士甲斗王的强大能力，但却不属于任何一个组织，这让交战双方都感到非常惊讶。 其实在这场纷争背后，有一个可怕的阴谋正在悄悄地进行……

有一颗陨石落到涩谷后，从陨石中出现了不明宇宙生物异虫，它们变成人类的样子生活在城市中，不断杀害人类。为了消灭这些异虫，人类成立了一个秘密组织杰特，该组织开发出了假面骑士系统。 某一天，杰特的实习队员加贺美新，遇到了一名古怪的男子天道总司，他称自己是“行天之道，总司一切的男人”。 就在加贺美新以为自己能得到甲斗王变身器的认可时，变身器却飞向了天道总司，利用甲斗王变身器和腰带成功变身成假面骑士甲斗王的天道总司，他能否凭借自己的力量守护世界呢？而这一切的背后所隐藏的秘密又是什么呢？

《幪面超人KABUTO》是幪面超人诞生35周年的纪念作品，其设计借鉴了昔日昆虫（巨型甲虫，日语为KABUTOMUSHI），并如同《幪面超人555》一样充满金属机械感。剧中新颖的战斗场面采用了类似《黑客帝国》的拍摄手法，大量运用CG技术，增强了速度感和视觉效果，KABUTO的技能和必杀技更凸显其潇洒有型。 故事背景设定为涉谷被掉落的宇宙陨石毁灭，七年后，宇宙生物WORM现身并四处杀害人类。即便日本特别组织ZECT出动应对，也收效甚微。成员加贺美新知晓只有新开发的腰带才能与宇宙生物抗衡，然而，拥有冷静头脑且身手敏捷的天道总司取得了甲虫形态KABUTO ZECTOR的控制权，变身为幪面超人KABUTO，成功打败了WORM。 七年前随陨石一同降临并毁灭涉谷的宇宙生物WORM，基本形态是绿色的“蛹”，它们统一以双手掩盖面孔，能够模拟所遇人类的外貌、行为和声音，在人类社会中进行杀戮和侵略活动，即便ZECT动用军事武器也难以……

终于，所有手表集齐，那一刻到来了…… 王者的诞生，背后隐藏着巨大的阴谋。神秘的组织突然出现，他们自称为历史的管理者。 身份立场的转变，跨越时间的旅行，亲密好友的背叛……庄吾、盖茨、月读、沃兹该何去何从？而他们的所作所为，与未来紧密相关！ 世界会开始崩溃吗？平成时代会被推翻重来吗？ 最大的谜题将会揭开！

残存而来的drive骑士表盘之谜，其关键隐藏在战国时代 　　与魔王 织田信张相遇，投身于历史上的战役的庄吾等人，在他们面前出现了一群以“Quarzer”自称所谓的时空管理者，本应是同伙的沃兹，却作为Quarzer的一员阻挡在众人面前，并表明了，庄吾等人战斗至今所隐藏的冲击的真相 　　常盘庄吾 假面骑士时王，隐藏在那存在之中巨大阴谋究竟是？跨越时空的冒险尽头，最终将会诞生的王 是明君还是暴君？ 　　假面骑士时王 真正的结局

本剧场版紧接TV版第27话。在27话良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套。当良太郎等人消灭完异魔神并想回到Den-Liner的时侯，却发现Den-Liner已经被牙王劫持…… 　　众人被逼留在过去，最坏的情况是良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃泰诺斯也因此不能附上良太郎的身体。在机缘巧合下，良太郎遇到10岁时的良太郎（剧中用“小太郎”代替）和异魔神齐格，并且在樱井的帮助下，开始了追踪Den-Liner之旅。 　　另一方面，回到江户时代的牙王成功夺得神之列车Gao-Liner，且抓住了追踪到来的良太郎，并坐着Gao-Liner回到1988年12月26日。 　　在1988年，良太郎恢复了记忆，但被牙王阻挠而不能变身。正当此时，樱井带同救兵出现，救兵则是三个不同时间的良太郎。于是，四个不同形态的电王同时出现，最Climax的战斗即将展开……

终于，所有手表集齐，那一刻到来了…… 王者的诞生，背后隐藏着巨大的阴谋。神秘的组织突然出现，他们自称为历史的管理者。 身份立场的转变，跨越时间的旅行，亲密好友的背叛……庄吾、盖茨、月读、沃兹该何去何从？而他们的所作所为，与未来紧密相关！ 世界会开始崩溃吗？平成时代会被推翻重来吗？ 最大的谜题将会揭开！